木棉科（学名：Bombacaceae）是锦葵目一科。该科约有20属，180种，广布于热带（特别是美洲）地区。我国原产1属2种，引种栽培5属5种。乔木或灌木，与锦葵科(Malvaceae)近缘，是热带的特征科。花通常大而美丽。
该科较有名的属种如：木棉属(Bombax)，8种，如红丝棉树(B. ceiba)；吉贝属(Ceiba)，10种，产木棉(kapok)；轻木属(balsa; Ochroma lagopus，木材特轻)；榴莲属(durian; Durio zibethinus)，产于马来亚，果实大，气味独特；瓜栗属(Pachira)，热带美洲的观赏植物；以及猴面包树属(baobab；Adansonia digitata)。
1998年根据基因亲缘关系分类的APG分类法和2003年经过修订的APG II分类法将本科合并到锦葵科中。 木棉科的许多树种具一个或多个有较高观赏价值的形态特征，可作为园林绿化树种使用。
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