巴彦淖尔市卫生健康委员会是内蒙古自治区巴彦淖尔市人民政府组成部门，成立于2019年3月18日，由原市卫生和计划生育委员会等部门整合组建 。现任负责人为书记伊拉特、主任段瑞敏，办公地址位于临河区金沙路东市卫生健康综合大楼 。主要统筹全市卫生健康事业规划与政策实施，涵盖公共卫生管理、疾病防控、医改推进、蒙中医药发展、卫生应急响应等领域，下设疾病预防控制与食品安全科、蒙中医药管理科等18个内设机构，核定行政编制31名 。
该机构围绕医疗资源优化持续推进区域医疗中心建设，2024年重点规划北京中医医院内蒙古医院投用及基层医养结合项目建设 。曾获2021年内蒙古自治区抗击新冠肺炎疫情先进集体和脱贫攻坚先进集体称号 ，并主导基层医疗卫生机构改革及远程医疗服务体系建设 。截至2023年底，全市基层医疗卫生机构总数835个，专业技术人员2303人，在岗乡村医生846人。2026年，乌拉特前旗中蒙医院加入内蒙古自治区中医重症专科联盟 。作为市级卫生行政主体，其职能覆盖政策制定、执法监督、政务公开等环节，通过门户网站、政务新媒体等渠道履行信息公开职责 。
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