珍珠马甲鱼体呈椭圆形，侧扁，头部较大且略尖，眼大，背鳍高而短，胸鳍圆扇形。银褐色的身体，乃至鳍边均布满了珍珠状的斑点，显得格外雍容华贵，这也是它名字的由来。它的嘴部一直到尾柄的基部，沿着身体两侧的侧线各有一条由黑色圆斑组成的条纹。珍珠马甲的腹鳍已经演化成为一对细细长长、金黄色的丝状触须，有触觉功能，能探测周围有无障碍物和辨别食物，在平时可以前后左右地摆动，犹如盲者探路的竹杖，异常敏锐。在不游动时，触须也会轻轻飘动，好像女孩在梳理自己长长的辫子，异常美丽。臀鳍长而宽，占到体长（珍珠马甲鱼的成鱼体长可达12cm左右）的2/3，始于腹鳍后，越向后越宽，直至尾鳍处。尾鳍后缘稍稍内凹，近似分珍珠马甲鱼叉。
