接近那几集的剧情。。。，699 逼近灰原秘密的黑影（前篇）700 逼近灰原秘密的黑影（后篇） （世良问小兰阿笠博士的车子颜色，假装在群马县与柯南偶遇，并试图让柯南通过她的手机与灰原哀联络，而步美等人困在被凶手纵火的小木屋中，灰原为了让大家逃生而服下APTX4869解药，世良对光彦拍下的视频中的宫野志保非常惊讶，另外此段视频也被安室透、冲矢昴通过网络看到。） 701 漆黑的特快列车（发车）702 漆黑的特快列车（隧道）703 漆黑的特快列车（交叉）704 漆黑的特快列车（终点） （首先是收到基德的预告，柯南与少年侦探团，小五郎，兰，世良真纯以及园子登上列车，而冲矢昴，工藤有希子受柯南拜托也悄悄上车了。 在列车上，按计划将计划进行侦探游戏，但是游戏变成了真正的杀人案，柯南一行人也开始找线索。 这过程中，哀多次感到自己附近有组织的气息，所以很紧张。先是看到了带着伤疤的赤井秀一，而后因为世良真纯的话语怀疑她是组织的人。 柯南通过推理中找出了凶手，还发现了基德的伪装身份。 世良真纯发现了带着伤疤的赤井秀一（波本扮演），于是追上去，在遇到危险时被冲矢昴（装扮也像秀一）救了，世良由此产生很大怀疑。 这一方面柯南拜托基德易容成灰原哀大人的样子，由哀通过耳机指导基德与组织成员对话一步一步引出了组织新出场的成员---波本。 而有希子也进行变装，一边接受柯南指示一边与贝尔摩德周旋，以此来保护哀。 最后波本身份知晓，安室透就是波本，但最后因为冲矢昴的出现，波本对秀一的生死产生了怀疑，要求贝尔摩德给他提供秀一死亡的相关资料，打算进一步调查。差不多就这样了。）
