屠呦呦奖（Tu Youyou Award），是以2015年诺贝尔生理学或医学奖得主屠呦呦教授命名的奖项，由瑞士巴塞尔的学术出版商MDPI于2016年设立。 该奖项旨在表彰在天然产物化学和药物化学领域做出杰出贡献的科学家。 自2024年起，奖项奖金调整为10万瑞士法郎，每两年评选一次。
2024年，该奖项授予美国印第安纳大学Richard DiMarchi教授与德国亥姆霍兹药物研究所Rolf Müller教授。 2025年10月3日，颁奖典礼在美国芝加哥大学举行。 往届获奖者包括中国北京大学的雷晓光等。
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