广州市第五中学金碧校区是广州市第五中学“一校两区”战略中的重要组成部分，于2022年7月经政府调整后重新归属五中管理，并增设高中部，按照国家级示范性高中标准面向全市招生。该校区总占地面积超2.7万平方米，地理位置毗邻地铁2号线、广佛线及10号线（建设中），通过基础设施改造升级实现了宿舍、食堂与教学设施的全面提升，同步共享五中本部的优质教育资源。2022年7月17日，校区迎来首届高一新生注册，校长裘志坚提出将金碧校区定位为与本部协同发展的“精品校区” 。
2026年，校区参与广州市普通高中自主招生，拟招122人，较上年新增79人，是当年新增自主招生计划数最多的学校（校区），录取最低控制线为普通高中第二梯度投档控制线，自主招生学生原则上集中编班 。
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