侯镜如于1994年因病去世，终年92岁。其晚年为两岸和平作出诸多贡献，担任重要职务且乐善好施。
辽沈战役期间，侯镜如遥控92军起义投诚，战后被蒋介石任命为福州“绥靖”公署副主任，后因继续策划国军部队起义被识破，逃到香港从事统战工作。新中国成立后不久，他返回大陆，担任国务院参事，后成为全国政协委员以及民革候补委员。1977年，开始担任北京政协主席以及全国政协常委等职务。
晚年，侯镜如担任黄埔同学会副会长，以该身份号召两岸和平，做了很多基础性工作。1989年，他担任全国政协副主席，官至副国级。此外，他乐善好施，用自有资金成立“侯镜如基金会”，资助家乡的贫困学生完成教育。
