小蝙蝠亚目（学名：Microchiroptera；英文名：insect-eating bats）是脊索动物门（Chordata）、脊椎动物亚门（Vertebrata）、哺乳纲（Mammalia）、翼手目（Chiroptera）的亚目，包含该目大部分物种。其第二指末端无爪，耳壳外缘不联成圆圈，通常具耳屏或对耳屏，颊齿具尖锐齿尖，呈典型食虫性结构。多数体型较小，眼小且吻较短，依赖发达的回声定位系统活动，部分种类鼻腔周围具鼻叶结构辅助声波发射，视网膜以视杆细胞为主并能感知紫外光 。
该亚目动物除南极外全球分布，以昆虫为主食，少数食花果或吸血。现存15科（存在17科分类争议），中国境内分布7科约123种。代表科如蝙蝠科、叶口蝠科、菊头蝠科等，其中叶口蝠科部分种类具吸血习性，菊头蝠科因马蹄形鼻叶得名，粪便可作药用。研究表明其回声定位系统与基因进化相关，部分种类携带巴贝虫属和巴尔通体属等血液寄生虫 。
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