黑龙江省疾病预防控制局是黑龙江省人民政府工作部门，隶属于黑龙江省卫生健康委员会 。该局于2023年5月29日正式挂牌成立 ，主要承担传染病预防控制、公共卫生监督、疫情监测预警体系建设及突发公共卫生事件应对等职责，下属黑龙江省疾病预防控制中心（公益一类正处级事业单位，财政全额拨款） 和黑龙江省传染病防治院（公益二类三级甲等专科医院，财政差额拨款） 两家直属单位。
2024年1月，省疾控局正式独立运行。2024年6月，该局召开第一次直属机关党员代表大会，选举产生第一届党委和纪委委员 。2024年9月，通过“黑龙江人才周”活动公开招聘40名事业单位编制工作人员 。2025年2月，与哈尔滨工业大学签署合作协议，共同建设“人工智能+疾控”联合实验室 。2026年2月，黑龙江省疾病预防控制工作会议在哈尔滨召开 。
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