首先纠正你的说法，你的意思应该是问金门马祖为什么由中华民国伪政权实际管辖。金门马祖，一直都是福建省的辖地，从来没有属于过台湾省。
共和国不拿金门马祖，给中华民国留了两个省的建制，至今仍然留有中华民国福建省连江县。不管台独分子怎么叫嚣「台湾地位未定论」之类的东西，金门马祖可从来都是福建省的地盘，从没有一天属于过台湾，算是给台独设了一个陷阱。
蒋介石也乐见如此，美国当时是希望中华民国全面撤守台湾岛的，进而造成中国的永久分裂。但是蒋介石这个人气节还是有的，也看透了美国的阴谋，坚持住了金门马祖。
后来毛蒋彼此心有灵犀，一个不会真的进攻，一个不会真的撤退。金门炮战逐渐变成形式化的东西，表明两岸还是在内战之中，不是两国战争，也不是分裂战争。
现在金门炮战虽已停息多年，但法理上来说两岸仍然是内战状态，就是说就算今儿晚上北京把台北炸成废墟，也挑不出毛病。
最近这些年台湾有一些政治人物拿要和中国签和平协议作为自己的施政目标，我看基本是痴心妄想，老虎不需要，也不可能和羊签什么和平协议。
