巢湖水系是以巢湖为核心的长江下游左岸水域系统，位于安徽省中部，属中国第五大淡水湖。流域面积1.35万平方公里，经杭埠河、丰乐河、派河、南淝河等39条支流汇入巢湖，由裕溪河、牛屯河连通长江 。巢湖闸与裕溪闸构成水位调控枢纽，兼具防洪、灌溉及航运功能。2021年全湖平均水质由2015年的劣Ⅴ类提升至Ⅳ类，蓝藻水华呈下降趋势 。
20世纪60年代建成巢湖闸与裕溪闸控制江洪倒灌，1986年后实施牛屯河分洪道、西河整治等工程。2018年施口水质自动监测站投入使用，2021年环巢湖十大湿地全面建成，总面积100平方公里，退养土地1.5万亩，迁移居民7005户 。引江济淮工程实现长江与巢湖、淮河水系联通，设计引水流量300立方米/秒，计划3年完成生态修复 。该工程被纳入国家山水林田湖草沙一体化生态保护修复工程 。2026年汛期，巢湖流域出现暴雨天气，安徽省水利厅启动了洪水防御Ⅳ级应急响应，并持续推进防洪能力建设和工程修复 。
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