上海航天电子有限公司（五三九厂、中国航天时代电子公司五三九厂、上海空间电子设备研究所），前身是上海科学仪器厂，成立于1957年5月，原隶属于中国科学院上海分院，1967年划转至中国空间技术研究院。2002年11月整建制划至中国航天时代电子公司，并以资产重组形式进入长征火箭技术股份有限公司，现录属于中国航天科技集团航天电子研究院（九院）。公司是我国最早从事航天产品研制，集研究、设计、试制、生产以及环模试验为一体的航天高新技术企业之一。
公司是上海市首批高新技术企业、首批重合同、守信用企业之一，自2001年以来一直被评为上海市AAA级诚信企业。2022年1月28日，该企业技术中心入选“2021年（第28批）新认定国家企业技术中心名单”。 2026年6月，上海航天电子有限公司联合中国航天科技集团一院研究发展中心通信研究团队，在新型电磁调控核心技术领域取得阶段性关键突破，成功完成超表面电磁调控核心技术功能样品研制。 2026年7月，上海航天电子有限公司公告称，拟将深空探测类业务相关资产与上海科学仪器厂有限公司持有的相关技改资产进行置换，差额部分以现金支付。
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