法国卫生部是法国政府负责全国卫生政策的制定与实施的部门。该部门主要通过“卫生预算”来实现其职能，2019年“卫生预算”中对主要研究机构的拨付经费为3.21亿欧元，并主管INCa、法国国家食品、环境与劳动卫生署、法国国家药品和保健食品安全署、法国国家公共卫生署等研究资助与科研机构 。在健康数据管理方面，法国卫生部下属的ASIP SANTÉ负责发布健康数据托管（HDS）条例 。
法国卫生部于1985年设立了“关于针刺治疗诸问题研究委员会” 。在应对新冠肺炎疫情时，2020年3月，法国卫生部禁止了所有1000人以上聚集活动 ，并于2020年7月20日起强制要求11岁以上民众在室内公共场所必须佩戴口罩 。2026年2月5日，法国卫生部公布了一项涵盖16项措施的全国行动计划，以应对生育能力下降等相关公共健康问题 。2026年6月，面对热浪，法国国家公共卫生署报告显示每日死亡人数增加，其中85%涉及65岁以上人群，法国卫生部长斯特凡妮·里斯特宣布因大量医院缺乏空调，已紧急下达3万台空调订单 。2026年7月3日至22日热浪期间，全国共出现1243例超额死亡，此前在6月17日至7月2日的热浪期间出现了5764例超额死亡 。2026年8月6日，法国卫生部确认一名曾在法国度假的法裔阿根廷游客感染汉坦病毒 。
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