基本赞同Iris的说法，略作补充。发炎是一种免疫系统的反应，是人类进化中获得的对抗疾病 （比如感染病，比如癌症）的手段。否则，在没有抗生素的古代，人类怕是存活不下来。发炎的大部分原因是异物反应。就是人体的免疫系统觉得见到了不属于自己体内的东西，所以开搞。(免疫细胞在发育的时候，会认清什么抗原是自身的，什么抗原不是)
发炎大概有以下情况
1 免疫系统见到病原体感染，开始搞病原体（细菌真菌病毒），对身体有益1.1 比如手臂上破个口子，免疫系统也会发炎，一方面是对抗可能出现的感染，一方面帮助治愈。
2 免疫系统见到癌症，开始搞癌症，对身体有益 （但是癌细胞也有办法能让免疫细胞疲劳和无效）3 自身免疫系统没发育好，看见自己体内的东西也搞，那会形成自身免疫病，比如类风湿性关节炎，系统性红斑狼疮，一型糖尿病，对身体有害.
2021更新，现在看，类风湿性关节炎更像是因为抽烟导致一个蛋白产生变化(citrullination)被免疫系统误识别。
3.1 自身被细菌/真菌/病毒等感染，部分免疫细胞被激活， 由于激活过多，不可避免地识别到自身组织（抗原和细菌等比较相似），形成自身免疫病。
4 器官移植，免疫系统见到新东西，开搞，对人体有害5 器官/组织发炎。例如关节炎中，关节磨损会形成组织残渣，组织残渣会引来免疫细胞发炎（参见1.1）免疫细胞开始搞关节细胞。关节细胞越死越多，引来的免疫细胞越搞越大，造成组织器官损伤，对人体有害。5.1 再或者皮肤被热物烫伤，虽然没有细菌感染，但是烫伤处死了一堆细胞，死细胞也会招来免疫细胞，开始发炎。6 过敏。过敏原可以是生存环境中的一切包括食物。根据过敏原不同发炎的位置也不同。比如花粉过敏，一般发生在呼吸道。对人体有害。
那么回到PO主的问题。对的，什么器官都能发炎。免疫系统搞谁，谁发炎。但是发炎的原因多种多样，可能是因为病原体感染，可能是其他刺激。
其实抗生素（Antibiotics）和消炎药 （Anti-inflmmatory drugs) 是完全两种不同的药，但是国内喜欢混着叫。抗生素就杀细菌。消炎药就是让免疫反应在对人体有害的时候，让他们消停消停。
更新：回答评论问题-
消炎药 抗生素药有哪些 能举几个例子吗？ 是不是一个是对抗病毒的 一个是对抗细菌的？
消炎药，比如阿司匹林，布洛芬，没有杀菌作用。 抗生素，青霉素，四环素，杀细菌不杀病毒。病毒现在比较难对抗，一般药都不是杀死病毒，是控制。 有少量对病毒有奇效的药，比如Gilead家的丙肝神药Sovaldi，是真正的治愈，那真是值一个诺贝尔奖的。
